20岁前后,孔尚任考取县府学生员。康熙二十一年(1682年),孔尚任35岁时,应衍圣公孔毓圻之请出山,修《家谱》与《阙里志》,教习礼乐子弟,采访工师,监造礼乐祭器,为康熙帝玄烨第一次南巡祭孔活动作准备。康熙二十四年(1685年)初,孔尚任进京,正式走上仕途。康熙二十九年(1690年),孔尚任回京,开始了10年京官生涯。康熙四十一年(1702年)末,孔尚任带着悲愤的心情回到家乡,过着清苦寂寞的生活[2]。
主要作品有《桃花扇》,和顾彩合撰的《小忽雷》传奇及诗文集《湖海集》《岸堂文集》《长留集》等[2]。世人将他与《长生殿》作者洪昇并论,称“南洪北孔”。