万历四十八年七月二十一日，万历帝病死。朱常洛继位为泰昌帝。登基十天后，泰昌帝却一病不起。泰昌帝病重，原郑贵妃宫中的内医崔文升入诊帝疾，他本应用培元固本之药，却反用去热通利之药，使泰昌帝腹泻不止，委顿不堪，后鸿胪寺丞李可灼进献红丸，自称仙丹。泰昌帝服后死去，而在当天，首辅方从哲拟遗旨赏了进献红丸的李可灼。随即有人怀疑是郑贵妃唆使下毒，并展开了一系列的追查元凶的举动。其间，党争与私仇夹杂其中，连坐罪死者众矣。天启皇帝朱由校迫于舆论压力，罢免内阁首辅方从哲，将崔文升发配南京，李可灼充军，此案草草收场[1]。
泰昌帝之死究系何因，始终未解，“红丸案”成为明宫疑案之一[1]。
万历朝的梃击案、泰昌朝的红丸案与天启朝的移宫案一直是天启朝争论的问题，史称晚明三大疑案[3]。